Эмиль Фишер - один из выдающихся представителей классической органической химии. Он занимался препаративной органической химией, изучением строения органических природных веществ, заложил основы биохимии.
Научная деятельность Фишера началась в так называемый период грюндерства, когда промышленность в Германии бурно развивалась за счет контрибуций, наложенных на побежденную Францию. Наряду с созданием машиностроения и электротехнической промышленности в Рейнской области и в Берлине возникли первые крупные химические предприятия, где на основе достижений органической химии было организовано производство красителей, а вскоре также лекарств и взрывчатых веществ. За короткое время в Германии возникло сорок два новых акционерных общества по промышленному производству химических продуктов. Некоторые из них вскоре погибли в конкурентной борьбе, другие же, наоборот, заняли монопольное положение в химической промышленности не только Германии, но и на мировом рынке.
Формирование личности Фишера как химика и преподавателя высшей школы приходится на этот период расцвета химической промышленности Германии. Его вклад в организацию высшего химического образования и химических исследований отвечал потребностям развивающейся монополистической формы ведения хозяйства, обеспечивая оптимальное использование в промышленности высококвалифицированных химиков. Усиленное стремление руководителей химической промышленности привлекать для работы широко образованных химиков и проводить интенсивные исследования было вызвано рано начавшейся (уже с 1870 г.) концентрацией производства и капитала в промышленности красителей. Яркое выражение эта тенденция капиталистического развития промышленности получила в предложении Дуисберга (1904 г.), согласно которому следовало по примеру американской промышленности объединить крупные химические предприятия Германии. Уже в 1904 г. были образованы такие крупные фирмы, как «Баденские фабрики по производству анилина и соды» (BASF), «Байеровское акционерное общество заводов по производству красителей» и «Акционерное общество по производству анилина» (AGFA), а также две компании с очень близким направлением деятельности: акционерное общество заводов красителей Хехста и компания Леопольда Казеллы, из которых в дальнейшем был образован концерн - «Имперское общество по производству красителей». Такая концентрация производства резко увеличила влияние мощной химической промышленности Германии на политическую жизнь страны. Это позволяет понять, почему в конце XIX в. значительно выросли расходы на строительство новых высших учебных заведений и исследовательских организаций.
Все эти факторы оказали значительное влияние на жизнь и деятельность Эмиля Фишера.