Однако ограниченность дуалистических представлений мешала химикам понять механизм превращений, протекающих иначе, чем образование солей. Так, электрохимическая теория Берцелиуса затруднила признание гипотезы Авогадро, имеющей более общую область применения в химии. При помощи дуалистических представлений нельзя было также объяснить многоатомность молекул газообразных простых веществ.
Существенное значение для превращения химии в точную науку имело усовершенствование Берцелиусом химической номенклатуры и создание им символики, близкой к современным обозначениям элементов и их соединений. Она заменила химические знаки Дальтона, в которых чувствовалось влияние алхимической символики. Для обозначения химических элементов Берцелиус предложил применять начальные буквы их латинских названий.
Исходя из своей электрохимической теории Берцелиус предложил принцип наименования соединений, состоящих из положительных и отрицательных частей. Например, сульфат меди он рас-сматривал как сернокислый оксид меди (CuOS03). В своей химической символике Берцелиус хотел отразить и количественное соотношение элементов в соединениях. Уже в 1815 г. он объяснил, что приводимые им формулы должны также «облегчать выражение отношений в химических соединениях... чтобы можно было бы однозначно отразить относительные массы соединяющихся частиц в каждом сложном теле. Если мы будем знать массу элементарной частицы, эти формулы... должны нам позволить выразить результаты количественного анализа таким же простым и легким для изображения способом, как это позволяют делать алгебраические формулы в механике».
Созданный Берцелиусом «химический язык» позволил простым м наглядным образом сопоставлять особенности химических явлений с составом взаимодействующих молекул. Тем самым этот «язык» в значительной мере способствовал взаимопониманию химиков разных стран и укреплению их научных контактов.
В результате своих аналитических работ Берцелиус открыл несколько новых элементов. Так, в 1803 г. вместе с В. Хизингером Берцелиус открыл элемент церий, который тогда же и независимо от шведских ученых обнаружил Клапрот. В 1817 г. Берцелиус выделил из шлама свинцовых камер сернокислотного производства в маленьком шведском городке Грипсхольме неизвестный до этого элемент - селен. Тогда же Берцелиус установил, что по свойствам селен близок к теллуру. В 1828 г. Берцелиус открыл в минерале, найденном в Норвегии, элемент торий. Вместе со своим учеником Н. Г. Сефстрёмом Берцелиус обнаружил в 1830 г. новый элемент ванадий. Впоследствии Берцелиусу удалось получить элементы, оксиды которых уже были известны: кремний, цирконий, титан, тантал.